Я обычно наношу термопасту одной не очень большой "каплей" по центру чипа, далее она сама распределяется равномерным тонким слоем под действием давления прижимаемого радиатора. По крайней мере, судя по данным температурного мониторинга, чипы таким подходом вполне довольны )